Сюжет мода не учитывает событий произошедших в Half-Life 2:Episode 1. После взрыва цитадели G-man погружает Гордона Фримена в стазис, но через некоторое время выводит его от туда для нового задания.

Цель этой миссии - проникнуть в цитадель, которая находится в City 18 (город, расположенный недалеко от City 17) и телепортироваться в мир Combine, для того чтобы устранить главного представителя их расы.